無(wú)菌室外源性污染源，主要是通過(guò)門(mén)和無(wú)菌室內外通道侵入的室外空氣。因此無(wú)菌室的布置通常都采用按照工藝操作的關(guān)鍵程度，潔凈度的高低由里往外逐級減弱，抵御室外污染空氣的侵入。同時(shí)為物料和人員進(jìn)出無(wú)菌室設置相應的控制措施，例如物料的氣閘、人員的無(wú)菌更衣系統以及室內廢棄物傳遞出來(lái)的通道等。無(wú)菌室內的污染源，主要來(lái)自于無(wú)菌室內必要的操作人員和部分工藝設備，通常無(wú)菌室內操作人員的四周區域是潔凈度最差的區域，也是無(wú)菌技術(shù)中重要的控制內容。

       在無(wú)菌室的設計中，通過(guò)向室內輸送定量的潔凈空氣，稀釋置換室內已使用過(guò)的潔凈空氣，將臟空氣排出室外，使室內的空氣潔凈度等級達到100000級、10000級或局部達到100級的空氣潔凈度要求，室內已使用過(guò)的臟空氣由清潔的空氣取代，在空氣的稀釋置換設計中，臟空氣與清潔空氣持續地混合稀釋?zhuān)饾u減少房間中的微粒負荷。置換稀釋設計對潔凈區域的空氣凈化系統的設計有很高的要求，而且必須考慮無(wú)菌室的布局和操作方式，還要為關(guān)鍵區間提供合適的局部單向空氣流動(dòng)保護，需要注意與空氣凈化系統供應的空氣一樣，滿(mǎn)布高效空氣過(guò)濾器的單向流動(dòng)罩產(chǎn)生的空氣流動(dòng)也可以置換稀釋房間中空氣傳播的微粒，這種空氣流動(dòng)會(huì )增加有效的房間空氣交換率，并有助于污染空氣置換稀釋。無(wú)菌室內空氣置換稀釋污染系統設計時(shí)應注意:潔凈空氣供應的體積應足以抵消空間中不斷產(chǎn)生的微粒數，以此維持工藝操作的基本條件要求;室內空間供應的空氣應比普通維持條件下空氣更清潔;要求混合供應的清潔空氣應滿(mǎn)足去除房間內含有微粒的空氣，以達到室內空氣置換稀釋的作用。

       無(wú)菌室內天花板應與風(fēng)管、管道、燈具、風(fēng)口等的安裝脫開(kāi)，光滑、無(wú)裂縫，易于清洗。無(wú)菌室的門(mén)窗材料應選擇耐受性好、自然變形小、制造誤差小、容易控制縫隙、氣密性好的材料，最好采用雙層中空玻璃結構的雙層窗，既節約空間、又節約能源，還可以避免玻璃窗結露引起霉變，造成污染;窗盡量采用大玻璃，這樣可減少積灰點(diǎn)，又有利于清潔工作。